Não, o systemd não é compatível com o upstart e não fará uso desses arquivos de trabalho iniciantes.
Existe esse diretório /etc/init com muitos arquivos *.conf que pertencem ao Upstart, mas eu tenho procurado na Web para saber se o Systemd é compatível com o Upstart. O Systemd é compatível com o SysV, também é compatível com o Upstart? Eu estou supondo que os arquivos .conf são instalados apenas por pacotes e não são usados pelo Systemd.
Não, o systemd não é compatível com o upstart e não fará uso desses arquivos de trabalho iniciantes.