Eu definitivamente verificaria se você precisa instalar um driver proprietário, que não é o Open-Source. Se o driver não estiver instalado, não há como o sistema operacional se comunicar com a GPU. Mas como a CPU é, o sistema utiliza a CPU para calcular a renderização de imagens em tempo real (o que você realmente vê na tela). Isso faz com que a CPU fique ocupada o tempo todo, enquanto ainda está na necessidade de calcular algoritmos diferentes.
Para verificar se o Driver GPU (Placa Gráfica) está instalado, a maneira mais fácil é (se você estiver usando o Ubuntu com o Gnome, não o Unity) para verificar sua barra (onde as notificações e o menu, gerenciador de janelas, etc. ), se indica uma sombra clara por baixo. Isso significa que o Compiz é ativado, produzindo uma aparência melhor de quase tudo. Como isso significa maior Consumo de Processamento, o Sistema precisa de uma Unidade de Processamento independente, como uma GPU (que basicamente é chamada de Co-Processador), para habilitar Potência de Processamento suficiente.
Se não acontecer, siga o primeiro passo que mencionei.
Espero que tenha ajudado