Dado que seu nome de usuário é john (substitua pelo que você tem), efetue login como root (isso não seria bom de qualquer forma) e mova o diretório contendo suas VMs para /home/john . Em seguida, supondo que o diretório de VMs do VirtualBox agora está localizado em /home/john/VirtualBox (novamente, altere conforme necessário), execute isso como root :
chown -R john:john /home/john/VirtualBox
Em seguida, faça o login como usuário normal (neste caso, john ), inicie o VirtualBox e, no menu, escolha Machine = > Add... para cada máquina.
Pode ser necessário ajustar as configurações da VM depois disso. Mas isso deve fazer o truque.