Para remover um segmento único de um arquivo webm, você pode usar o método padrão de procurar uma seção específica do seu arquivo e, em seguida, especificar um tempo para extrair.
Por exemplo, o seguinte levará uma seção de 1 minuto para um arquivo e copiará 60 segundos depois disso em outro arquivo:
avconv -ss 00:01:00 -i video.webm -t 60 -c copy cut.webm
Para extrair vários segmentos de um arquivo webm, você pode usar o segmentador de fluxo básico da avconv. Por exemplo, o seguinte dividirá um vídeo da web em segmentos de 60 segundos e também gerará um arquivo de lista de reprodução:
avconv -i test.webm -c copy \
-f segment -segment_time 60 -segment_list list.pls \
output%03d.webm
Algumas escolhas a serem feitas com o segmentador, mas os exemplos acima, abordam o básico ...