O Lubuntu é baseado no Ubuntu, então o núcleo do sistema operacional é o mesmo. Como Xen disse, a principal diferença entre os dois é que eles têm diferentes ambientes de desktop .
O instalador, a menos que você esteja usando a imagem do MinimalCD (que usa uma interface de usuário baseada em texto e baixa os arquivos do sistema em vez de armazená-los no instalador) é essencialmente o mesmo que o instalador padrão do Ubuntu - diferentemente.
Assim, como o núcleo do SO é o mesmo, a menos que você o configure manualmente, os instaladores instalarão o sistema operacional da mesma maneira que o software incluído.