Por alguma razão, isso é o que causou o problema:
Eu estava compartilhando meu diretório raiz via samba e tentando navegar através dele para criar o backup, ou seja, fazendo backup para smb: //192.168.1.2/root/media/SG_MEDIA. Foi isso que relatou o espaço livre de 3GB.
No entanto, quando compartilhei diretamente meu HD conectado, ou seja, criando um compartilhamento de samba diretamente para / media / SG_MEDIA e fazendo backup para smb: //192.168.1.2/SG_MEDIA, ele relatou o espaço correto. Não posso dizer o porquê.