Obtenha o dvd ao vivo gParted no link
Grave em um disco como você faria com uma instalação normal do Ubuntu.
Inicialize a partir dele e você terá uma sessão gParted onde todos os seus discos normais não serão montados para que você possa manipulá-los (e encolher é uma dessas opções).
Lembre-se: sempre faça um backup de arquivos importantes antes de mexer com partições.