Não, você não deve mexer com esses diretórios: há uma boa razão pela qual você não pode modificá-los por padrão.
Você usa o Ubuntu Software Center ou o comando apt-get
(em um terminal) para instalar um novo software no Ubuntu. Embora você não tenha aprendido os fundamentos do Linux, não é recomendável modificar esses diretórios manualmente.
Por exemplo, para instalar o navegador Chromium por meio do terminal que você executa:
sudo apt-get install chromium-browser
Ou graficamente,
- Abra o Dash (tocando na tecla Windows / Super)
- Digite
software center
e selecione Ubuntu Software Center - Pesquise
chromium web browser
no centro de software - Instale o resultado da pesquisa (também é possível ler uma descrição do aplicativo).