A saída colorida de ls é de um alias padrão incluído no Ubuntu. Tente executar ls --color=auto e veja se você ainda consegue cores. Os aliases padrão estão em $ HOME / .bashrc. Você pode adicionar mais em $ HOME / .bash_aliases. Você editou esses arquivos durante a configuração?
Para executar um comando sem aliases, prefixe com uma barra como \ls .