Uma atualização de versão removerá alguns pacotes de seu sistema, mas em geral a maioria dos pacotes atualmente em uso será atualizada para novas versões e seu sistema e a maioria dos aplicativos que você usa no momento permanecerão os mesmos.
Sobre as personalizações, estamos falando de uma história diferente:
- Se você estiver falando sobre personalizações simples, por exemplo: papel de parede e o tamanho dos ícones do inicializador, provavelmente nada será alterado;
- Outras alterações mais detalhadas no sistema podem ser revertidas pela atualização, e os efeitos de personalização precisarão ser aplicados novamente com versões atualizadas das ferramentas usadas para personalizar sua área de trabalho.
14.04 é o próximo LTS, quando você fizer o upgrade, provavelmente ficará feliz com ele e desfrutará de 5 longos anos de suporte e estabilidade. Eu diria que é melhor atualizar e testar do que se preocupar agora. Se você precisar reinstalar e fazer menos, apenas se necessário, e se estiver preocupado com a estabilidade, faça-o para uma versão LTS como 14.04.