Então, de acordo com a saída de dpkg -l | grep schedule
você tem o gnome-schedule instalado, que provavelmente está programando um desligamento às 12 da meia noite todos os dias. Basta tentar abrir o gnome-schedule e remover a atividade programada que encerra o sistema todos os dias às 12h à meia-noite (se houver algum).
Se você quiser, pode anexar uma tela do gnome-schedule na pergunta, para que eu possa verificar se há alguma "atividade de desligamento".