Para desativar o serviço cups
via upstart, tente executar a seguinte raiz as :
echo "manual" > /etc/init/cups.override
Você pode se tornar root executando: sudo -s
ou su
Extraído do Cookbook Upstart
Esta estrofe dirá ao Upstart para ignorar o início de on / stop nas estrofes. É útil para manter a lógica e a capacidade de um trabalho no sistema, embora não seja iniciado automaticamente na inicialização.
Exemplo:
manual