Acabou de se cadastrar para espalhar a solução para esse problema de aninhamento.
Certifique-se de ter o pacote xserver-xorg-input-libinput instalado. Então você precisa remover o pacote xserver-xorg-input-synaptics e reiniciar. Após o reinício, você tem todas as opções de volta na GUI.
Tudo é tratado pelo xserver-xorg-input-libinput agora. xserver-xorg-input-synaptics está interferindo nisso.