Então, se eu entendi bem, você quer que os usuários que você vai criar no Ubuntu consiga acessar o desktop Ubuntu a partir do seu PC Windows.
Para conseguir isso, você precisará ter em cada PC Windows dos usuários um X Server em execução. De fato, na família de ferramentas Cygwin, existe uma.
Pessoalmente, eu uso o MobaXterm que fornece um cliente SSH, FTP, ..., um servidor X local e muitos outros recursos. Uma vez que os usuários estão definidos no servidor Ubuntu, você terá que criar uma sessão XDMCP neste aplicativo.
Observação : por padrão, o protocolo XDMCP não está habilitado no Ubuntu. Para ativar o servidor XDMCP no LightDM, edite /etc/lightdm/lightdm.conf
e adicione a seguinte seção:
[XDMCPServer]
enabled=true
Em seguida, reinicie o LightDM: sudo restart lightdm