O Ubuntu 12.04 é uma versão de suporte de longo prazo do Ubuntu e é suportado com manutenção e segurança.
Por outro lado, o Gnome 3.6 (acho que você se refere ao Gnome Shell) é mantido pela Comunidade Gnome e a única maneira de se manter atualizado é usar o launchpad externo, repositórios não oficiais . Os PPAs que estão disponíveis para o gnome eventualmente retornarão o 3.6, mas isso pode quebrar seu sistema se você não souber o que está fazendo.
Existem muitas mudanças nas bibliotecas do Gnome que não são totalmente compatíveis com o 12.04 e é melhor atualizar para o 12.10 quando estiver pronto. Esta versão irá sincronizar suas bibliotecas GTK3 com o upstream do Gnome 3 e será mais confortável para você ter o Gnome 3.6.
Além disso, há um Ubuntu 12.10 Gnome Remix (Gnomubuntu) que será projetado para atender às necessidades das pessoas que desejam o Gnome Shell 3.x em vez do Unity.