Eu não tenho um Nexus 4 (apenas 7 e 10) para testar isso, mas ...
Etapa 1.
Reinicie o dispositivo:
Pressione e segure os botões Potência + Aumentar Volume + Diminuir Volume , durante 5-7 segundos.
Agora você deve estar na tela Bootloader ('green START')
Etapa 2.
Use o botão Diminuir volume duas vezes , para mostrar 'Recovery Mode' (em vermelho)
Em seguida, pressione Power , para reiniciar no 'Recovery Mode'.
Isso primeiro mostrará o logotipo do Google por 4 a 6 segundos.
Em seguida, mude para o modo de recuperação (com um logotipo do Ubuntu em círculo branco).
Etapa 3.
Agora você deve conseguir verificar uma conexão USB.
adb devices
deve retornar "recuperação"
Agora você pode fazer o download de uma nova instalação para o dispositivo.
Certifique-se de que apenas o dispositivo de destino esteja conectado. Isto irá não verificar o dispositivo anexado, e irá simplesmente instalar o software para um Nexus 4 (mako).
phablet-flash -b -d mako
UPDATE (10-ago-2013 em diante)
A sintaxeagora mudou para:
phablet-flash cdimage-touch -b -d mako
Se isso não funcionar, restaure o dispositivo para as configurações do Android (de fábrica).