Não importa onde você coloca esse script, contanto que você adicione o diretório que o contém ao seu PATH. Você pode fazer isso editando seu .profile (tipo gedit ~/.profile no terminal) para adicionar a linha PATH=/path/to/script:$PATH (substitua path/to/script pelo caminho correto).
No entanto, pode ser uma má ideia simplesmente adicionar qualquer diretório ao PATH, porque o que estiver nele será adicionado. Você pode querer criar uma pasta chamada bin em sua HOME e colocar o script lá; Eu acredito que é bastante normal, e já deve estar no seu PATH, se existir.