eu encontrei a mesma diferença, quando eu instalei a versão mais recente para um amigo. Acontece que há um pacote, que você pode instalar como uma atualização por conta própria, que não é instalado automaticamente para você com qualquer tipo de procedimento de atualização.
sudo apt-get install linux-image-genérico-lts-quantal linux-headers-genérico-lts-quantal
deve fazer o truque. Isso também mantém atualizado o kernel 3.5 recém-instalado!
Se você encontrar problemas com drivers proprietários ou de samba, simplesmente reinstale-os ...