Você está tendo um problema com seus aplicativos qt que não estão honrando seu tema gtk.
O que você faz é instalar o qt4-qtconfig e configurar seus aplicativos qt para honrar o tema gtk.
sudo apt-get install qt4-qtconfig
qt4-qtconfig
Pelo menos no Lubuntu 14.04.02 ao invés do qt4-qtconfig, deve-se usar
qtconfig
Na caixa "Selecionar estilo GUI", selecione "GTK +"
Para detalhes, consulte meu blog .