Xubuntu
Para o seu caso, você tem o gerenciador de arquivos Thunar , no qual você usaria:
gksu thunar ou gksudo thunar
Kubuntu
Se você tivesse o Kubuntu, então o gerenciador de arquivos seria o Dolphin , no qual você usaria:
kdesu dolphin ou kdesudo dolphin
Ubuntu / Mythbuntu / Edubuntu
Se você tivesse o Ubuntu, usaria o Nautilus como gerenciador de arquivos e usaria:
gksu nautilus ou gksudo nautilus .
Lubuntu
Se você tivesse Lubuntu, usaria PCManFM como gerenciador de arquivos e usaria:
gksu pcmanfm ou gksudo pcmanfm .