O problema pode ser uma de algumas coisas.
Se não houver um sistema operacional na unidade principal do seu mini, o BIOS pode não estar inicializando a partir do pen drive USB e, em vez disso, está tentando inicializar a partir da unidade principal. Este é apenas o caso se você puder inicializar o sistema normalmente sem o stick USB. Se você tem uma nova unidade vazia, esta é certamente uma possibilidade. A leitura dos documentos sugere que você pode entrar no menu de inicialização pressionando 0 repetidamente durante a tela POST.
A outra possibilidade é que o pen drive esteja sendo inicializado, mas não há MBR nele. O MBR é invisível para o usuário em sua maior parte, portanto, sua falta de inclusão não seria óbvia. Sua melhor opção aqui é tentar fazer o pendrive novamente, enquanto lê as instruções novamente ... é fácil perder esse pequeno detalhe algumas vezes. Além disso, alguns pendrives são estranhos, então pode valer a pena tentar um diferente se você tiver um prático.