Os aplicativos que você deseja abrir dependem de ter um servidor X Window System ativo para manipular o desenho gráfico e a entrada do usuário e transmiti-lo ao aplicativo. Aplicativos X NÃO podem funcionar em standalone , o que parece ser o que você deseja fazer.
Para entender um pouco mais sobre isso, você deve ler a arquitetura do sistema X window. Um possível lugar para fazer isso é este howto (é um pouco desatualizado, mas o princípio arquitetural ainda é o mesmo): link
Se você não quiser iniciar o ambiente gráfico ao inicializar, desabilitar o lightdm é o caminho a percorrer, mas ainda será necessário iniciá-lo se quiser que um aplicativo gráfico seja executado. Você pode fazer isso manualmente usando o comando startx
.
Se sua preocupação é sobre o ambiente gráfico consumindo muitos recursos, o que você deve fazer é instalar um ambiente mais leve (como o xfce) e selecionar a sessão xfce no lightdm.