Eu tenho Ubuntu 12.04 e, inicialmente, escolher o Ubuntu normal no login me deu Ubuntu 3D . No entanto, por alguns dias, selecionar Ubuntu ou Ubuntu 2D me dá 2D :
~$ echo $DESKTOP_SESSION
ubuntu-2d
Sua placa gráfica não suporta o modo 3D.
Eu posso ser um problema com seus drivers gráficos. Acontece frequentemente após uma atualização do kernel. (ainda mais se for uma placa gráfica ati ou nvidia)
Você pode confirmar isso com este comando: glxinfo | grep rendering (instale o glxinfo se você não tiver)
Você pode precisar reinstalar seu driver gráfico se for nvidia ou ati.
Deixe-me um comentário se precisar de mais explicações.
Se você tiver um laptop com gráficos híbridos, também pode surgir o problema que você enfrenta. Então você pode querer olhar para o projeto Bumblebee que permite que seus gráficos híbridos funcionem corretamente.