Atualmente, o Ubuntu One não suporta a sincronização de um NAS. Além disso, lembre-se de que não é uma ferramenta de backup, porque ela não preserva nenhum histórico, e a exclusão acidental no seu dispositivo causará a exclusão em nossos servidores!
O mecanismo sugerido é fazer um backup e depois sincronizar o backup, exatamente como você está fazendo.