Você nunca deve fazer esse tipo de coisa sem ter um backup. Sempre. Mas o que você deve ser capaz de fazer é inicializar uma sessão usb, apagar tudo no seu sistema de arquivos raiz, exceto / home e redimensioná-lo. Em seguida, você pode criar uma partição separada para / home e mover os arquivos para ela e, em seguida, instalá-la. (Por favor, investigue isso antes de começar a fazer qualquer coisa)
Mas em qualquer caso, você não deve instalar uma versão diferente do Ubuntu sem primeiro limpar o sistema de arquivos raiz. Está pedindo grandes problemas.