Eu tive esse problema com uma GPU nvidia embutida na placa-mãe. (Um componente GeForce 6150SE como parte do chipset nForce 430).
Abrindo o nvidia-settings, notei que o driver estava convencido de que a placa tinha 256MB de RAM, embora a RAM fosse uma RAM compartilhada do sistema, e a BIOS tinha configurado para 64MB.
Definir a alocação de RAM da BIOS para 256 MB corrigiu o problema com janelas brancas, como em receitas que anteriormente produziam janelas brancas que não eram mais confiáveis.
No entanto, o desempenho gráfico agora é um pouco lento, com operações como arrastar janelas e alternar espaços de trabalho provocando pausas.
Embora seu problema pareça estar com Natty, isso foi no Oneiric.