Se você ainda quiser saber, consulte /usr/share/themes/Ambiance/gtk-2.0/gtkrc - por exemplo, para o tema Ambiance. Pesquise o estilo "barra de rolagem" . Sob a linha engine "murrine" , você pode encontrar tal sintaxe:
trough_shades = {1,3, 1,2}
Parece usar a cor de fundo padrão (definida como bg_color no início do arquivo) e você apenas usa uma sombra. Esses valores para tons resultam em uma cor próxima a branco - alterei as tonalidades para alterar a barra de rolagem gtk-2 para algo como sobrepor uma.
Lembre-se, se você alterar o bg_color, todas as janelas de todos os aplicativos gtk-2 serão afetadas; então talvez seja melhor tentar diferentes valores de sombra. Se você não sabe, os valores maiores que 1 tornam a cor mais clara e os menores mais escuros.