Eu mesmo criei um pequeno aplicativo notificador do Gmail. Deveria haver um pedaço de código no script python que diz:
server = indicate.indicate_server_ref_default()
server.set_desktop_file("/usr/share/applications/gmail_notifier.desktop")
O arquivo .desktop especificado acima é aquele que determina o ícone a ser usado no menu de mensagens. A tecla "Icon" correspondente no meu arquivo .desktop é assim:
Icon=mail-unread
A descrição da chave "Ícone", conforme especificado na Especificação de entrada na área de trabalho , é:
Ícone para exibir no gerenciador de arquivos, menus, etc. Se o nome for um caminho absoluto, o arquivo fornecido será usado. Se o nome não for um caminho absoluto, o algoritmo descrito na Especificação do Tema do Ícone será usado para localize o ícone.
No meu caso, a segunda parte da descrição acima se aplica (ou seja, o algoritmo descrito no Tema do ícone A especificação é usada para localizar o ícone correspondente a "mail-unread". Você pode dar o caminho absoluto para o seu ícone, como em:
Icon=/usr/share/icons/...
ou você pode tentar o seguinte (ele funcionará somente se o tema do ícone tiver o ícone, o que é raro. É por isso que estou usando o ícone genérico "mail-unread".):
Icon=gmail
Não estou na minha máquina agora, mas quando chegar, direi exatamente onde você pode encontrar o ícone desejado e qual é o nome dele. Eu também tenho links para (os poucos) bons recursos que descrevem como integrar aplicativos com o menu de mensagens, mas novamente eu preciso estar na minha máquina para isso.
Se você tiver interesse em todo o código do meu aplicativo, eu o tenho no no GitHub .