VNC e NX são protocolos totalmente diferentes . Portanto, você não pode simplesmente descartar o suporte para um, porque um é superior ao outro no caso de uso.
Analogamente, só porque o IMAP fornece mais recursos, os agentes de usuários de e-mail não descartarão apenas o suporte a POP3.
Quando se trata de implementações de protocolos, geralmente em bibliotecas, o Ubuntu pode decidir qual deles é 'melhor' e escolher como padrão ou até mesmo descartar um deles. No entanto, a maioria dos aplicativos só será interrompida se a implementação da biblioteca for alterada (a menos que seja compatível com o ABI, é claro).
Por favor, lembre-se que você não pode dizer
[...] VNC como um produto principal [...]
Porque não é um.