Abra o Terminal e execute o seguinte comando primeiro para permitir valores alfa personalizados para o encaixe
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock customize-alphas true
Em seguida, execute o seguinte para definir o valor alfa máximo como 1 (ou seja, completamente opaco)
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock max-alpha 1.0
Em seguida, efetue logout e faça login novamente.