A maneira mais fácil de iniciar um arquivo de script no PyCharm é clicar com o botão direito do mouse na janela de ferramentas Projeto (normalmente ela é encaixada à esquerda como uma barra lateral ou deve ser aberta com Alt + 1 ou no menu Visualizar → Windows ) e selecione Executar no script menu de contexto do arquivo.
Isso gerará automaticamente uma configuração de execução que será exibida no menu suspenso ao lado do botão Executar na barra de ferramentas.