Ao usar o programa Disks, eu consegui reformatar o pendrive para que ele fosse reconhecido como um pendrive e não como um CD. Foi aparentemente formatado com ISO9660 como um sistema de arquivos. Discos foi capaz de montar o stick usb em seu estado malformado, permitindo-me excluir a partição pré-existente e reformatá-lo como FAT32. Montar a unidade do gerenciador de arquivos gui também funciona agora.