Como discutimos em um bate-papo , o motivo era que NTFS
filesystem em questão estava sujo e continha metadados em cache. Uma tentativa de montá-lo resultou em:
The disk contains an unclean file system (0, 0).
Metadata kept in Windows cache, refused to mount.
Falling back to read-only mount because the NTFS partition is in an
unsafe state. Please resume and shutdown Windows fully (no hibernation
or fast restarting.)
Failed to daemonize.
Version 2016.2.22AR.1 integrated FUSE 28
Mounted /dev/sda2 (Read-Only, label "", NTFS 3.1)
Cmdline options:
Mount options: allow_other,nonempty,relatime,ro,fsname=/dev/sda2,blkdev,blksize=4096
Ownership and permissions disabled, configuration type 7
Depois de corrigi-lo com ntsfix OP foi capaz de remover o arquivo.