O Gedit trabalha com plugins. Existem 2 que provavelmente fazem o que você quer. Um é chamado de "Embedded Terminal" e o outro "External tools", mas ambos não fazem parte dos plugins instalados padrão. Você pode adicionar mais com
sudo apt-get install gedit-plugins
E, em seguida, selecione essas opções na seção "Plugins":
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"ferramentas externas", controle, alt, T abrirá um terminal:
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"Terminal incorporado" adicionará um console permanente ao final do gedit. Você também pode precisar ativar o "painel inferior" de "visualizações":
E aí está.