Da sua pergunta, parece que você deseja um recurso "desfazer" geral do sistema operacional. Tal recurso não existe. No entanto, se você estiver executando o Ubuntu em uma máquina virtual, a maioria dos softwares de virtualização permite que você tire instantâneos e reverta para um instantâneo anterior, caso algo dê errado.
Caso contrário, o melhor que você pode fazer é certificar-se de fazer backups frequentes, saber o que está fazendo e testar comandos em um ambiente seguro (como uma VM ou um usuário normal) antes de executá-los em seu ambiente de produção . Para comandos simples, como a instalação de pacotes, você pode remover o pacote ( apt-get remove <package_name> ), mas tudo isso seria caso a caso, é claro. Nem todo comando simples tem um simples "desfazer".