Primeiro monte suas partições do HDD
Vamos supor que sdb
seja seu disco rígido externo e sdb1
seja a partição para a qual você deseja copiar seus dados.
Execute sudo mount /dev/sdb1 /mnt
para montar sdb1
para /mnt
. Para copiar qualquer coisa para HDD externo, execute cp <required_file> /mnt/<some_folder>