Se você quiser iniciar a janela normal do Konsole na inicialização, em vez de criar um arquivo, deverá usar o serviço de inicialização (Autostart in plasma). Supondo que você esteja executando o KDE, navegue para:
System Settings -> Startup & Shutdown -> Autostart -> Add Program..
Adicione o seguinte ao campo:
konsole -e --noclose command
Substitua command
pelo comando desejado.