liblapack.so.3gf não encontrado

Question

Eu preciso executar algumas análises no R 2.14 (essa versão antiga é necessária para executar um pacote antigo). Estou usando o Ubuntu 16.04 LTS de 64 bits. Eu preciso do packag quantreg em R. Mas isso me dá algum erro: liblapack.so.3gf e libblas.so.3gf não são encontrados.

> lien@lien:~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/quantreg/libs$ ll
drwxr-xr-x  2 lien lien   4096 déc.  12 11:45 ./
drwxr-xr-x 10 lien lien   4096 oct.  16  2012 ../
-rw-rw-r--  1 lien lien      0 déc.  12 11:45 export
-rw-r--r--  1 lien lien 254176 déc.   8 16:51 libblas.so.3
lrwxrwxrwx  1 root root     31 déc.  12 09:43 liblapack.so.3gf -> /usr/lib/R/lib/liblapack.so.3gf
lien@lien:~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/quantreg/libs$ ldd quantreg.so 

Esta é a saída do "ldd quantreg.so"  - linux-vdso.so.1 = > (0x00007fff435fc000)  - liblapack.so.3gf = > não encontrado  - libblas.so.3gf = > não encontrado  - libgfortran.so.3 = > /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.3 (0x00007f3a65cf9000)

• libm.so.6 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007f3a659f0000)

• libR.so = > /usr/lib/libR.so (0x00007f3a6543e000)

• libc.so.6 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007f3a65074000)
• libquadmath.so.0 = > /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0 (0x00007f3a64e35000)
• libgcc_s.so.1 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libgcc_s.so.1 (0x00007f3a64c1f000)

• lib64 / ld-linux-x86-64.so.2 (0x000055780a4b9000)

• libblas.so.3 = > /usr/lib/libblas.so.3 (0x00007f3a649e0000)

• libreadline.so.6 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libreadline.so.6 (0x00007f3a6479a000)

• libpcre.so.3 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libpcre.so.3 (0x00007f3a6452a000)
• liblzma.so.5 = > /lib/x86_64-linux-gnu/liblzma.so.5 (0x00007f3a64307000)
• libbz2.so.1.0 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libbz2.so.1.0 (0x00007f3a640f7000)
• libz.so.1 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007f3a63edd000)
• librt.so.1 = > /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007f3a63cd4000)
• libdl.so.2 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007f3a63ad0000)

• libgomp.so.1 = > /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgomp.so.1 (0x00007f3a638ae000)

• libpthread.so.0 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007f3a63690000)

• libatlas.so.3 = > /usr/lib/libatlas.so.3 (0x00007f3a630f2000)
• libtinfo.so.5 = > /lib/x86_64-linux-gnu/libtinfo.so.5 (0x00007f3a62ec8000)

No entanto, ambos os pacotes libblas e liblapack estão instalados:

> lien@lien:~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/quantreg/libs$ dpkg -l | grep 'openblas\|atlas\|lapack' 
ii  libatlas3-base   3.10.2-9         amd64      Automatically Tuned Linear Algebra Software, generic shared 
ii  liblapack3       3.6.0-2ubuntu2   amd64      Library of linear algebra routines 3 - shared version

Eu já tentei fazer um lync para liblapack.so.3gf mas isso também não funciona. Eu não tenho muita experiência com o Ubuntu, e realmente não sei o que mais posso tentar.

    

Answer 1

No ubuntu 16.04, instalar os pacotes liblapack3 e libblas3 deve corrigir seu problema.