Certamente, se houver som funcionando em outros players de mídia, obviamente há um problema local com som em vlc. Duas sugestões que devem corrigir o problema para tentar na ordem:
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Redefina a configuração vlc para padrões executando o seguinte comando:
vlc --reset-config --reset-plugins-cache
Isso pode ser suficiente para corrigir o problema, mas, se não, tente o seguinte:
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Siga este caminho na vlc:
Tools >> Preferences >> Audio >> Output >> Output Module
Selecione um "Módulo de saída" diferente na caixa suspensa. Esta captura de tela ilustra as opções em uma instalação vlc padrão no Xenial Xerus:
Alguns experimentos podem ser necessários com essas opções até que você encontre uma opção feliz que produza som ...