Resolvido, em qualquer futura pessoa que tenha o mesmo problema que eu, você pode remover o comando de execução do menu Iniciar em /home/username/.config/lxpanel/LXDE/panels/panel
e editando esta linha
item {
command=run
}
uma vez apagado, o menu de execução desaparecerá depois que você digitar um console lxpanelctl restart