Parece que você conectou a unidade externa à porta USB2. USB2 tem mais sobrecarga computacional e velocidade menor que USB3, se você tiver USB3 - conecte a unidade a essa porta.
Use o comando lsusb -t
para descobrir a velocidade do fio do disco rígido.
E, a propósito - se for disco rígido regular, não SSD - você está limitado pela física. HDDs convencionais são capazes de ler ou gravar de um local físico no momento. Se você pedir para fazer várias leituras / gravações - os cabeçotes precisam ser reposicionados com frequência, o que afeta a velocidade geral de leitura / gravação.
==== Autor apontou para problema de hardware - ver comentários.