Pelo que entendi você não quer software como MultiBootUSB, YUMI ou MultiSystem. Você já instalou o WindowsToGo, tudo que você precisa fazer é criar uma partição Linux após a partição do Windows e instalar o Lubuntu como se fosse instalá-lo em qualquer outro disco rígido. Sua unidade USB provavelmente será listada como sdb, sdc, etc. Certifique-se de não confundi-la com hda ou sda, que é o disco rígido interno do seu PC. E certifique-se de que o GRUB (bootloader do LUbuntu) será instalado em / sdb (a raiz da sua unidade USB), caso contrário, o Lubuntu permanecerá instalado, mas indisponível.