Existe uma correção publicada aqui . Parece ter feito o truque para mim, mas não tenho 100% de certeza que é o mesmo problema para você. Este é um problema com o Flash e sua aceleração de hardware, e não o próprio YouTube.
Caso o site acima esteja indisponível, veja a correção:
sudo mkdir /etc/adobe
echo "OverrideGPUValidation = 1" | sudo tee -a /etc/adobe/mms.cfg