Parece que meu poder do Google foi enfraquecido: isso é um bug conhecido ( concentre-se nos comentários de Colin Watson) e ele ficará por algum tempo sem nenhuma correção à vista:
Citando Colin Watson : [...] Deixar todos os pacotes como instalados manualmente é desagradável, mas as conseqüências desse bug geralmente são limitadas a não ser inteligente o bastante para remover pacotes que não são mais necessários. Uma falha na direção inversa seria muito pior, porque poderia fazer com que os pacotes fossem removidos quando ainda fossem necessários. Dado que não parece haver uma correção claramente correta disponível, é melhor arejar [sic] por precaução. [...]