Eu tive um problema semelhante com meu laptop que estava tendo Nvidia GTX 950M (quase perto do que você tem).
Meu conselho, mesmo que os drivers proprietários da Nvidia possam ter um desempenho melhor - é melhor manter as versões de código aberto, já que elas parecem ser mais compatíveis (pelo menos no meu caso para duas máquinas nos últimos 6 meses)
Aqui estão os passos
Geralmente você deve usar os drivers dos repositórios oficiais do Ubuntu.
Porque você está tendo problemas, usar os drivers mais recentes pode ser melhor.
Instale os drivers oficiais mais recentes da NVIDIA para o GEFORCE GTX 960M.
Baseado neste link você deve instalar o nvidia-361 (que suporta GTX 960M ). M é a variante móvel - nos desktops você não encontrará M no final do modelo.
Primeiro desinstale os drivers NVIDIA atualmente instalados. Inicialize o computador, quando o menu GRUB aparecer ...
Destaque a entrada do menu do Ubuntu e pressione a tecla E. Adicione nouveau.modeset=0
ao final da linha linux. Pressione F10 para inicializar o sistema operacional Ubuntu.
Quando a tela de login aparecer, pressione Ctrl + Alt + F1.Insira seu nome de usuário e a senha e execute:
sudo apt-get purge nvidia*
sudo reboot
Agora instale os drivers NVIDIA estáveis oficiais mais recentes. Inicialize o computador, quando o menu GRUB aparecer ...
Destaque a entrada do menu do Ubuntu e pressione a tecla E. Adicione nouveau.modeset=0
ao final da linha linux. Pressione F10 para inicializar o sistema operacional Ubuntu.
Quando a tela de login aparecer, pressione Ctrl + Alt + F1.
Digite seu nome de usuário e a senha e execute:
sudo add-apt-repository ppa:graphics-drivers/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install nvidia-361 nvidia-prime
sudo reboot
Nota:
Talvez seja explicitamente necessário selecionar o adaptador NVIDIA no BIOS.
Quando você deseja usar os drivers 361, não é necessário adicionar o PPA.
Neste caso, os comandos do terminal que você deve executar são estes:
sudo apt-get update
sudo apt-get install nvidia-361
sudo reboot
No caso de você ter instalado o driver nvidia do seu site, então desinstale-o conforme as instruções. Desinstale esse driver executando, como root, sh ./NVIDIA-Linux-x86_64-361.28.run e siga as instruções na tela.
Nota: A solução que forneci foi testada no Ubuntu 14.04 LTS e no Ubuntu 15.10 para duas GPUs.