Acho que algo atrapalhou a propriedade do diretório inicial e, portanto, gnome-terminal
não conseguiu obter e definir corretamente os valores de configuração.
Provavelmente isso foi causado pela execução de qualquer tipo de dconf
editor ou outro aplicativo com sudo
que alterou algumas propriedades de arquivo.
A solução é muito simples e também pode ser aplicada a uma carga de outros problemas:
Recupere a propriedade de todos os arquivos e pastas em seu diretório pessoal:
sudo chown -R $USER: ~