Tentar fazer uma instalação inicializável do Ubuntu com um utilitário do Windows a partir do Linux Mint não vai funcionar. O Linux Mint vem com uma ferramenta de criação de disco de inicialização gráfica, se você precisar de uma GUI.
Na minha opinião, é melhor fazer isso no terminal.
Abra um emulador de terminal e execute: sudo dd if=/path/to/ubuntu.iso of=/dev/sdX
em que sdX é o nome do dispositivo do seu pendrive. Isso geralmente não é sda
. Certifique-se de ter o dispositivo certo antes de executar o comando.