Se você mudou o tema, pode ser o motivo. Veja o seguinte relatório de bug: Gnome-terminal no Ubuntu Unity encolhe para o tamanho mínimo
Se você estiver usando o tema do ambiente (padrão), seria bom se você pudesse atualizar o relatório de erros.
Eu tive o mesmo problema com o tema zukimac, mas não com ambient ou arc.
Para corrigir isso, tente abrir o aplicativo Appearance (por exemplo, em System Settings) e altere o tema para "Ambiance".