Existe uma maneira de fazer com que o wget seja baixado recursivamente da maneira que você quer:
wget -r --no-parent -nH --cut-dirs=1 --reject "index.html*" http://archive.ubuntu.com/ubuntu/project/
O sinalizador -nH --cut-dirs=1 elimina a estrutura de diretórios.
Isso baixará recursivamente ou basicamente cp -r a pasta do projeto do site para um novo diretório chamado ~/project .
Total de 2 diretórios e 11 arquivos baixados.