Eu realmente não entendo o que você está fazendo ou porque você escolheu um caminho tão complexo. Tudo o que você precisa fazer é adicionar path/to/folder/ à sua variável PATH (que é a lista de diretórios que serão pesquisados por executáveis). Edite ~/.profile e adicione esta linha:
PATH=$PATH:path/to/folder/
Agora, você poderá executar X diretamente, seja da linha de comando ou de um iniciador. Alternativamente, aponte seu lançador (eu acho que você quer dizer arquivo .desktop) para path/to/folder/ . Supondo que este seja um programa GUI, não há razão para ter um terminal associado a ele.